یکی از مزیت‌های برجسته این صندوق، بهره‌مندی از مشوق‌های مالیاتی مصرح در ماده ۱۱ قانون جهش تولید دانش‌بنیان است. طبق این ماده قانونی، بانک‌ها می‌توانند معادل ۳۰ درصد از مبلغ سرمایه‌گذاری‌های خود در صندوق‌های پژوهش و فناوری یا شرکت‌های دانش‌بنیان را به‌عنوان اعتبار مالیاتی ثبت کرده و از مالیات سال جاری یا سال‌های آتی کسر کنند. این مشوق مالیاتی به‌طور چشمگیری هزینه‌های مالی سرمایه‌گذاری را کاهش می‌دهد و به سرمایه‌گذاران کمک می‌کند تا با اطمینان بیشتری در پروژه‌های نوآورانه مشارکت کنند. کاهش ریسک مالی به کمک این اعتبار مالیاتی، در کنار بازده پیش‌بینی‌شده بالای طرح‌های دانش‌بنیان، جذابیت سرمایه‌گذاری در صندوق پژوهش و فناوری پاسارگاد را دوچندان کرده است.